Из-за высокой стоимости кохлеарного импланта операция, как правило, проводится на одном ухе. Обычно операцию проводят на хуже слышащем ухе, для того чтобы пациент мог продолжать носить слуховой аппарат на другом ухе. В некоторых случаях операция выполняется на лучше слышащем ухе. Например, если у пациента есть аномалия или оссификация (окостенение) улитки, или если пациент потерял слух в детстве и носил слуховой аппарат только на одном ухе.